種牡馬と繁殖牝馬がともに因子を持たず、その１代前の祖先の種牡馬が能力系因子を持つ場合に成立する。
※能力因子：スピード・スタミナ・瞬発力・勝負根性・パワー
種牡馬と繁殖牝馬がともに因子を持たず、父父または母父が能力因子を持つ場合に成立する。
隔世遺伝の対象となる祖先馬は１頭のみであり、優先度は父父＞母父となる。
隔世遺伝の成立によって得られる効果と爆発力は以下の通り。
| 条件 | 効果 | 爆発力 | |
|---|---|---|---|
| 隔世遺伝 | 種牡馬・繁殖牝馬がともに因子を持たず、 父父または母父が能力系因子を持つ場合。 | 対象となる祖先馬の 因子の種類に対応する能力ｕｐ | 対象となる祖先馬が スピード因子を持つ場合 スピード因子の数×３ｕｐ |
≪例：種牡馬スキャンの場合≫
通常スキャンは因子を持たない。
配合相手となる繁殖牝馬が因子を持たない場合、スキャンの父のミスタープロスペクターがスピード因子を２個持つため、隔世遺伝により爆発力が３×２＝６上昇する。